O início do torneio está previsto para o dia 14 de setembro e a final para 16 de novembro e terá transmissão no Eleven e Paulistão Play e 17 clubes, o formato da Copa Paulista 2021 está definido e os participantes foram divididos em quatro grupos regionalizados, sendo três com quatro clubes e um com cinco equipes. Após turno e returno, os dois mais bem colocados de cada chave avançam para o mata-mata.
Os quatro classificados fazem as semifinais e, posteriormente, os dois clubes que avançarem farão a final. O campeão tem a opção de escolher entre uma vaga da Copa do Brasil ou do Campeonato Brasileiro da Série D. O vice-campeão fica com a outra opção.
Confira os grupos da primeira fase da Copa Paulista:
Grupo 01
Botafogo F S/A
AE Velo Clube
Comercial FC
CA Votuporanguense
Grupo 02
EC São Bento
Rio Claro
EC XV de Piracicaba
EC Noroeste
Grupo 03
Santos FC
São Bernardo FC
EC São Bernardo
EC Primavera
Grupo 04
AD São Caetano
SC Atibaia
EC Taubaté
CA Juventus
A Portuguesa Desportos